Identificación de genes implicados en el desarrollo de la Nefropatía diabética y su regulación inducida por miRNAs. Un análisis in silico

Resumen

Introducción. La nefropatía diabética (ND) es la principal causa de enfermedad renal terminal en todo el mundo, se caracteriza por la excreción patológica de albuminuria mayor a 300mg/dL/24h, hiperglicemia y presión arterial alta. El diagnóstico certero de esta enfermedad requiere de un análisis histológico de biopsias renales donde usualmente no se obtienen muestras suficientes para procedimientos repetidos, por lo que en los últimos años se han propuesto diversas biomoléculas para la identificación oportuna y diagnóstico certero de diversas enfermedades incluida la ND. En los últimos años se ha reportado que los miRNAs desempeñan un papel clave en el desarrollo de la enfermedad. Los miRNAs son RNAs pequeños, no codificantes, que regulan la expresión genética de manera postranscripcional y han sido propuestos como potenciales enfermedades como: enfermedades cardio metabólicas, del metabolismo óseo, diversos tipos de cáncer y diabetes.

Objetivo. Por lo que en este trabajo a través de un análisis in sílico se identificaron miRNAs y sus respectivos genes blancos asociados con ND. Metodología. Para la identificación de miRNAs se realizó una búsqueda de datos donde se utilizaron tecnologías de análisis de genoma completo como microarreglos de expresión, se recuperaron archivos en formato CEL, se normalizaron los datos y se realizó un análisis de expresión diferencial. Posteriormente se identificaron los genes diana de cada miRNA seleccionado y se analizaron para identificar las vías de señalización en las que se encuentran implicados a través de la herramienta KEGG pathway. Resultados. Se identificaron tres miRNAs asociados con ND de los cuales 57 genes son regulados por estos tres miRNAs y participan en 7 vías de señalización KEGG relacionadas con ND y enfermedad renal crónica. Estos datos permitieron generar una red que representa la interacción entre miRNAs y genes. Conclusiones. Alteraciones en los perfiles de expresión de miRNAs y genes diana pueden afectar múltiples procesos biológicos y conducir al desarrollo de la ND. Por lo tanto, los miRNAs y los genes implicados en el desarrollo de la ND podrían ser de interés clínico como potenciales biomarcadores o moléculas para el diagnóstico y monitoreo de la enfermedad. Finalmente, este análisis, utiliza métodos estandarizados para la búsqueda de genes blancos de miRNAs y análisis de microarreglos lo que permite que estos resultados puedan ser replicados.