Diagnostic yield of Next-Generation Sequencing in the study of patients with Global Developmental Delay/Intellectual Disability.
Keywords:
Global developmental delay, gdd, Intellectual Disability, next-generation sequencing, NGS, Exome, diagnostic yieldAbstract
Introducción.
El retraso global del desarrollo (RGD) se define como una falla para adquirir los hitos apropiados para la edad, en dos o más de las cinco áreas del desarrollo: motricidad fina y gruesa, lenguaje y habla, funciones cognitivas, desarrollo personal y social, así como, actividades de la vida diaria, en niños menores de 5 años. el algoritmo de abordaje genético se ha modificado en los últimos años, pasando de microarreglos a exoma completo (Secuenciación de nueva generación-NGS).
Objetivo;
Realizar el análisis bioinformático de las variantes obtenidas mediante la secuenciación completa del exoma por NGS relacionadas con RGD/DI, de los datos de 10 pacientes con RGD.
Metodología.
Se realizó estudio descriptivo, transversal, observacional y analítico. Se realizó la secuenciación del exoma. Técnica: Preparación de las bibliotecas genómicas a través del kit MGIEasy Exome FS Library Prep Set y captura de las regiones exónicas mediante el kit MGIEasy Exome Capture V5 Probe set., Secuenciación masiva de las bibliotecas (paired end 2x90pb) (MGI), Análisis bioinformático de los datos obtenidos.
Resultados.
Se incluyeron un total de 10 pacientes con diagnóstico clínico de RGD/DI. Todos los casos presentaban afectación en las cinco áreas del desarrollo. En 6 pacientes se identificaron variantes patogénicas o probablemente patogénicas, que pueden explicar el fenotipo de los pacientes. De éstos, 3 presentaron variantes en el número de copias (CNV, copy number variants) y 1 presentó hallazgos secundarios con implicaciones para una nueva perspectiva en la medicina preventiva. Los genes involucrados fueron: PUF60, ASPM, GJB2, HNF1A, PNPLA3, NF1, SCN1A, CLCN1.
Conclusiones
El estudio de los pacientes con RGD/DI es un gran reto por la gran cantidad de genes involucrados en vías de función neurológica. El poder lograr un diagnóstico etiológico permite un adecuado asesoramiento genético, que incluye riesgo de transmisión de los padres, hermanos y otros familiares, evolución, pronóstico y posibles tratamientos de diversos tipos, como reemplazos, rehabilitación, medicamentos, etc.
La NGS demuestra que, en este momento, es la mejor opción para lograr el mayor rendimiento diagnóstico posible.
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